日本政策金融公庫と制度融資のダブル申請はＯＫですか？

基本的には、ＯＫです。なぜなら、どちらかに断られることがあるからです。ですので、どちらか一方からしか借りないという前提の同じ計画を双方へ出してください。結果として両方から借りることになっても問題ありません。